Medetomidin hat den chemischen Namen 4-1-(2,3-dimethylphenyl)ethyl)-1H-imidazol (O'Neil 2001a). Es existiert ein Derivat, das Medetomidinhydrochlorid, das die Summenformel C13H16CN2HCl besitzt und ein Molekulargewicht von 248,76 hat. Medetomidinhydrochlorid ist eine weisse kristalline Substanz, die löslich in Wasser ist (O'Neil 2001a).
Medetomidinhydrochlorid sollte bei Raumtemperatur (15 - 30°C) aufbewahrt und nicht tiefgekühlt werden (Plumb 2002a).